Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XPNPEP3Q9NQH7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XPNPEP3Q9NQH7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms