Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARD6AQ9NPB6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARD6AQ9NPB6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARD6AQ9NPB6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms