Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZCCHC17Q9NP64 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZCCHC17Q9NP64 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZCCHC17Q9NP64 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms