Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VIPAS39Q9H9C1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VIPAS39Q9H9C1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms