Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SUDS3Q9H7L9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUDS3Q9H7L9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms