Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCX3BQ9H321 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCX3BQ9H321 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCX3BQ9H321 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCX3BQ9H321 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCX3BQ9H321 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCX3BQ9H321 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCX3BQ9H321 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3BQ9H321 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3BQ9H321 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms