Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UPF3BQ9BZI7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UPF3BQ9BZI7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.55■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UPF3BQ9BZI7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms