Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
KRTAP9-8Q9BYQ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms