Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PACSIN1Q9BY11 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PACSIN1Q9BY11 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms