Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HERC2P3Q9BVR0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HERC2P3Q9BVR0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC2P3Q9BVR0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC2P3Q9BVR0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms