Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNPPD1Q9BV87 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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CNPPD1Q9BV87 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPPD1Q9BV87 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNPPD1Q9BV87 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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