Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VPS25Q9BRG1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VPS25Q9BRG1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms