Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMP4Q99727 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMP4Q99727 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMP4Q99727 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMP4Q99727 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMP4Q99727 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMP4Q99727 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMP4Q99727 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMP4Q99727 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMP4Q99727 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMP4Q99727 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMP4Q99727 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMP4Q99727 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMP4Q99727 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMP4Q99727 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMP4Q99727 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMP4Q99727 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMP4Q99727 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMP4Q99727 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMP4Q99727 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMP4Q99727 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMP4Q99727 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMP4Q99727 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMP4Q99727 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMP4Q99727 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMP4Q99727 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMP4Q99727 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMP4Q99727 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMP4Q99727 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMP4Q99727 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMP4Q99727 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMP4Q99727 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMP4Q99727 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMP4Q99727 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMP4Q99727 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMP4Q99727 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMP4Q99727 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMP4Q99727 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMP4Q99727 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMP4Q99727 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMP4Q99727 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMP4Q99727 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMP4Q99727 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMP4Q99727 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMP4Q99727 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TIMP4Q99727 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMP4Q99727 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMP4Q99727 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMP4Q99727 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms