Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF11Q99590 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF11Q99590 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF11Q99590 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF11Q99590 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF11Q99590 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF11Q99590 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF11Q99590 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF11Q99590 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF11Q99590 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF11Q99590 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF11Q99590 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF11Q99590 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF11Q99590 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAF11Q99590 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF11Q99590 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF11Q99590 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF11Q99590 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF11Q99590 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF11Q99590 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF11Q99590 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF11Q99590 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF11Q99590 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF11Q99590 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF11Q99590 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAF11Q99590 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SCAF11Q99590 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SCAF11Q99590 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SCAF11Q99590 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SCAF11Q99590 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SCAF11Q99590 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF11Q99590 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms