Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PFDN5Q99471 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN5Q99471 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms