Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZIM3Q96PE6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIM3Q96PE6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms