Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C8orf48Q96LL4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C8orf48Q96LL4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C8orf48Q96LL4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms