Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMD3Q96D46 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMD3Q96D46 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms