Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP6V1E2Q96A05 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1E2Q96A05 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms