Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
TOPBP1Q92547 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
TOPBP1Q92547 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC39.57■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
TOPBP1Q92547 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms