Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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TMEM239Q8WW34 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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TMEM239Q8WW34 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TMEM239Q8WW34 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM239Q8WW34 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TMEM239Q8WW34 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TMEM239Q8WW34 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TMEM239Q8WW34 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM239Q8WW34 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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