Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RASGEF1CQ8N431 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RASGEF1CQ8N431 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASGEF1CQ8N431 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms