Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW03

SIAH3, Seven in absentia homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH3Q8IW03 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIAH3Q8IW03 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIAH3Q8IW03 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms