Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM139Q8IV31 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM139Q8IV31 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM139Q8IV31 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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