Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SKAP1Q86WV1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKAP1Q86WV1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SKAP1Q86WV1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms