Protein–RNA interactions for Protein: Q86TM6

SYVN1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYVN1Q86TM6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYVN1Q86TM6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYVN1Q86TM6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYVN1Q86TM6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYVN1Q86TM6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYVN1Q86TM6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYVN1Q86TM6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYVN1Q86TM6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYVN1Q86TM6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYVN1Q86TM6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYVN1Q86TM6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms