Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF3Q7Z739 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDF3Q7Z739 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YTHDF3Q7Z739 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1139.9 ms