Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.37
LRRC9Q6ZRR7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LRRC9Q6ZRR7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LRRC9Q6ZRR7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LRRC9Q6ZRR7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms