Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCGB1D4Q6XE38 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB1D4Q6XE38 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms