Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD4L3Q6VB84 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
FOXD4L3Q6VB84 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXD4L3Q6VB84 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms