Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC62Q6P9F0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC62Q6P9F0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC62Q6P9F0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms