Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WSCD1Q658N2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WSCD1Q658N2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms