Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMTC4Q5T4D3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMTC4Q5T4D3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMTC4Q5T4D3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms