Protein–RNA interactions for Protein: Q5BVD1

TTMP, TPA-induced transmembrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTMPQ5BVD1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTMPQ5BVD1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTMPQ5BVD1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTMPQ5BVD1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTMPQ5BVD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTMPQ5BVD1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTMPQ5BVD1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTMPQ5BVD1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTMPQ5BVD1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTMPQ5BVD1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTMPQ5BVD1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms