Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
C4orf17Q53FE4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C4orf17Q53FE4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C4orf17Q53FE4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms