Protein–RNA interactions for Protein: Q16630

CPSF6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF6Q16630 TANGO2-224ENST00000485715 617 ntTSL 512.47□□□□□ -0.415e-8■□□□□ 10
CPSF6Q16630 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-10■□□□□ 10
CPSF6Q16630 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.465e-8■□□□□ 10
CPSF6Q16630 RALBP1-202ENST00000383432 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-10■□□□□ 10
CPSF6Q16630 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.561e-10■□□□□ 10
CPSF6Q16630 RALBP1-203ENST00000458039 836 ntTSL 311.34□□□□□ -0.591e-10■□□□□ 10
CPSF6Q16630 RALBP1-201ENST00000019317 4368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.671e-10■□□□□ 10
CPSF6Q16630 SARS-205ENST00000477544 694 ntTSL 29.71□□□□□ -0.862e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 SARS-206ENST00000482384 804 ntTSL 29.57□□□□□ -0.882e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 SMC4-223ENST00000493695 457 ntTSL 28.7□□□□□ -1.022e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 58.45□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.092e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 THOC2-203ENST00000416618 657 ntTSL 58.22□□□□□ -1.092e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 THOC2-209ENST00000448128 1365 ntTSL 58□□□□□ -1.132e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 CLNS1A-206ENST00000526761 415 ntTSL 37.43□□□□□ -1.222e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 THOC2-213ENST00000464604 664 ntTSL 27.31□□□□□ -1.242e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 CLNS1A-205ENST00000526009 747 ntTSL 37.26□□□□□ -1.252e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 ZCCHC7-206ENST00000488607 884 ntTSL 27.13□□□□□ -1.272e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.331e-10■□□□□ 10
CPSF6Q16630 EIF3J-204ENST00000536248 533 ntTSL 26.58□□□□□ -1.368e-14■□□□□ 10
CPSF6Q16630 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.362e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 THOC2-215ENST00000464992 902 ntTSL 56.39□□□□□ -1.392e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 THOC2-205ENST00000432353 3188 ntTSL 1 (best)5.93□□□□□ -1.462e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.512e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.612e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.692e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.722e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 THOC2-208ENST00000441692 4364 ntTSL 53.83□□□□□ -1.82e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.982e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.072e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 SRSF2-204ENST00000452355 1357 ntTSL 514.93□□□□□ -0.021e-12■□□□□ 10
CPSF6Q16630 EPC2-202ENST00000397424 672 ntTSL 318.09■□□□□ 0.493e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 EPC2-205ENST00000457184 724 ntTSL 517.35■□□□□ 0.373e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 EPC2-203ENST00000409654 1624 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.493e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.242e-6■□□□□ 10
CPSF6Q16630 ATP5I-203ENST00000506525 496 ntTSL 1 (best)13.92□□□□□ -0.182e-7■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 ATP5I-202ENST00000505852 300 ntTSL 29.26□□□□□ -0.932e-7■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 ATP5I-201ENST00000304312 365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.062e-7■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 ATP5I-205ENST00000515202 393 ntTSL 26.32□□□□□ -1.42e-7■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 ATP5I-204ENST00000515116 247 ntTSL 24.18□□□□□ -1.742e-7■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.132e-18■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.472e-18■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.852e-18■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.92e-18■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.142e-18■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 37.16□□□□□ -1.262e-18■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.292e-18■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.962e-18■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.278e-13■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.288e-13■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 NACA-201ENST00000356769 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.738e-13■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 NACA-215ENST00000550920 752 ntTSL 59.38□□□□□ -0.918e-13■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 NACA-204ENST00000546392 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.068e-13■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.28e-13■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 NACA-208ENST00000547914 543 ntTSL 57.23□□□□□ -1.258e-13■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.258e-13■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.418e-13■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 NACA-210ENST00000548386 644 ntTSL 26.23□□□□□ -1.418e-13■□□□□ 9.9
CPSF6Q16630 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.812e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 322.83■■□□□ 1.253e-61■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.933e-61■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 316.1■□□□□ 0.173e-61■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 215.34■□□□□ 0.053e-61■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.463e-61■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 510.61□□□□□ -0.713e-61■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.763e-61■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.823e-61■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.843e-61■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.983e-61■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 RBBP6-210ENST00000568015 695 ntTSL 315.16■□□□□ 0.021e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 RBBP6-201ENST00000319715 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.781e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.861e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 RBBP6-208ENST00000564726 514 ntTSL 38.59□□□□□ -1.031e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.051e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 RBBP6-207ENST00000564314 3361 ntTSL 27.73□□□□□ -1.171e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 RBBP6-209ENST00000567686 1138 ntTSL 57.54□□□□□ -1.21e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 SRPK2-207ENST00000466917 2565 ntTSL 26.8□□□□□ -1.321e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 RBBP6-213ENST00000613729 1946 nt6.33□□□□□ -1.41e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 SUPT6H-203ENST00000577713 505 ntTSL 55.83□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 RBBP6-205ENST00000562430 6482 ntTSL 1 (best)5.57□□□□□ -1.521e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 SRPK2-213ENST00000485455 436 ntTSL 35.21□□□□□ -1.581e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.581e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.681e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.731e-6■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PSMA4-212ENST00000559365 786 ntTSL 525.03■■□□□ 1.62e-7■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PSMA4-215ENST00000559934 2741 ntTSL 1 (best)21.25■□□□□ 0.992e-7■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PSMA4-218ENST00000560099 2596 ntTSL 220.11■□□□□ 0.812e-7■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PSMA4-219ENST00000560217 944 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.652e-7■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.862e-7■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.172e-7■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.232e-7■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PSMA4-220ENST00000560737 815 ntTSL 56.8□□□□□ -1.322e-7■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.42e-7■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.642e-7■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.682e-7■□□□□ 9.8
CPSF6Q16630 TMEM259-210ENST00000592618 1877 ntTSL 523.94■■□□□ 1.421e-7■□□□□ 9.7
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