Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNCBQ16143 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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