Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF56Q15929 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF56Q15929 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF56Q15929 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF56Q15929 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF56Q15929 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF56Q15929 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF56Q15929 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF56Q15929 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF56Q15929 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF56Q15929 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF56Q15929 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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