Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18Q15532 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18Q15532 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18Q15532 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18Q15532 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SS18Q15532 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18Q15532 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18Q15532 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18Q15532 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18Q15532 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18Q15532 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18Q15532 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18Q15532 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18Q15532 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18Q15532 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18Q15532 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SS18Q15532 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18Q15532 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18Q15532 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18Q15532 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18Q15532 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18Q15532 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18Q15532 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18Q15532 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18Q15532 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18Q15532 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SS18Q15532 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18Q15532 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18Q15532 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18Q15532 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18Q15532 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18Q15532 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18Q15532 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18Q15532 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18Q15532 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18Q15532 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18Q15532 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18Q15532 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SS18Q15532 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18Q15532 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18Q15532 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18Q15532 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18Q15532 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18Q15532 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18Q15532 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SS18Q15532 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18Q15532 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SS18Q15532 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18Q15532 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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SS18Q15532 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SS18Q15532 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SS18Q15532 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SS18Q15532 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18Q15532 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SS18Q15532 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18Q15532 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SS18Q15532 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SS18Q15532 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18Q15532 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18Q15532 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18Q15532 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18Q15532 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18Q15532 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18Q15532 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SS18Q15532 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SS18Q15532 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18Q15532 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18Q15532 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18Q15532 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18Q15532 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18Q15532 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18Q15532 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18Q15532 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18Q15532 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18Q15532 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SS18Q15532 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18Q15532 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18Q15532 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18Q15532 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18Q15532 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SS18Q15532 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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