Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
R3HDM1Q15032 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
R3HDM1Q15032 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms