Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN5AQ14524 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN5AQ14524 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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