Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA1CQ13936 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CACNA1CQ13936 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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