Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTAN1Q13813 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPTAN1Q13813 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms