Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SHROOM2Q13796 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SHROOM2Q13796 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SHROOM2Q13796 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
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