Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SEMA3FQ13275 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA3FQ13275 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3FQ13275 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
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