Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGM3Q08188 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGM3Q08188 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGM3Q08188 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms