Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLEQ07864 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLEQ07864 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLEQ07864 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLEQ07864 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLEQ07864 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLEQ07864 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLEQ07864 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLEQ07864 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLEQ07864 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLEQ07864 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLEQ07864 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLEQ07864 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLEQ07864 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLEQ07864 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLEQ07864 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLEQ07864 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLEQ07864 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLEQ07864 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLEQ07864 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLEQ07864 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLEQ07864 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLEQ07864 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLEQ07864 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLEQ07864 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLEQ07864 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLEQ07864 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLEQ07864 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLEQ07864 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLEQ07864 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLEQ07864 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLEQ07864 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLEQ07864 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLEQ07864 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLEQ07864 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLEQ07864 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLEQ07864 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLEQ07864 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLEQ07864 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLEQ07864 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLEQ07864 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLEQ07864 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLEQ07864 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLEQ07864 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLEQ07864 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLEQ07864 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLEQ07864 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLEQ07864 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
POLEQ07864 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLEQ07864 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLEQ07864 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLEQ07864 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLEQ07864 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLEQ07864 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLEQ07864 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
POLEQ07864 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLEQ07864 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLEQ07864 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
POLEQ07864 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLEQ07864 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLEQ07864 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLEQ07864 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLEQ07864 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
POLEQ07864 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
POLEQ07864 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLEQ07864 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLEQ07864 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLEQ07864 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLEQ07864 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
POLEQ07864 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLEQ07864 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLEQ07864 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLEQ07864 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLEQ07864 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLEQ07864 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
POLEQ07864 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1537.5 ms