Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAX2Q02962 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAX2Q02962 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms