Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB1P62873 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB1P62873 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB1P62873 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB1P62873 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB1P62873 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB1P62873 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB1P62873 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB1P62873 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB1P62873 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB1P62873 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB1P62873 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GNB1P62873 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB1P62873 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB1P62873 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB1P62873 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB1P62873 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB1P62873 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB1P62873 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB1P62873 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB1P62873 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB1P62873 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB1P62873 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GNB1P62873 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB1P62873 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB1P62873 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB1P62873 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB1P62873 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB1P62873 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GNB1P62873 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB1P62873 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB1P62873 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB1P62873 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB1P62873 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB1P62873 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB1P62873 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB1P62873 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB1P62873 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB1P62873 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GNB1P62873 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB1P62873 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB1P62873 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB1P62873 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB1P62873 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB1P62873 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB1P62873 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB1P62873 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB1P62873 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GNB1P62873 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GNB1P62873 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GNB1P62873 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GNB1P62873 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GNB1P62873 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms