Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2D3P61077 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBE2D3P61077 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1222 ms